機場、火車站、長途汽車站、輪船港口的蠅類防治工作和其他地方一樣也是要著重消除蠅類的孳生物(地),使之在機場、車站、港口范圍內及其附近地區無蠅類孳生。在這基礎上做好防蠅和消滅成蠅的工作。歸納有如下內容：
每班飛機、每趟列車、輪船帶來的廢棄物和排泄物的處置不論是飛機、列車或輪船眾多旅客經過長途旅行都會產生大量生活垃圾,應采用塑料垃圾袋或加蓋垃圾桶盛裝。到站后,及時卸下運送到垃圾消納場所,列車垃圾量大,可在旅客下車之后,列車回到編組站,再卸下垃圾進彳行處理。機場應有卸飛機糞便容器的專用設施;內河航運應備有專門卸客輪糞便的專用碼頭,糞便的最終處理應灌入化糞池進行無害化處理。
候機廳、候車室、候船室。候機廳(包括隔離區內)、候車(船)室都應設置符合衛生標準的廁所,機場的廁所應堅持高標準應杜絕蠅類孳生。室內應設置足夠的垃圾箱和果皮箱,切實做到日產日清,而且清徹底。人員流動多的機場、車站應做到24小時保潔。
對機場跑道、停機坪、列車站臺、站前廣場及其附近500米范圍內的垃圾、污物等孳生物(地)應進行清理,并應經常保持清潔。機場通常遠離市區,常建有消納機場本身垃圾的垃圾處理場或垃圾中轉站,處理場(中轉站)應遠離跑道和侯機樓,至少1000米以外。車站月臺上、站前廣場等地應設置適量的垃圾箱、果皮箱,并有專人負責,日產日清。
機場、車站、港口附設的餐廳、廚房、快餐部、冷飲部售貨亭、售貨柜(車)等均應按照飲食行業的要求,做好防蠅和蠅工作。
對侵入飛機機艙、列車車廂、輪船船艙以及候機廳、候車(船)室等各類室內的成蠅可采用氣霧殺蟲劑、噴射殺蟲劑或蠅拍隨時撲殺。一般在已經做好生物(地)治理的基礎上,不主張在室內再大量使用滯留噴灑殺蟲劑的辦法。如能裝置適量的紫外線燈誘電擊式滅蠅器,特別是廚房、餐廳等場所,則是非常合適的。